使用口腔拭子基因组DNA提取试剂盒回收的DNA可适用于各种常规操作,包括酶切、PCR、文库构建、 Southern杂交等实验。
注意事项 请务必在使用本试剂盒之前阅读此注意事项。 1.若缓冲液GA或GB中有沉淀,可在37℃水浴中重新溶解,摇匀后使用。 2.所有离心步骤均使用台式离心机,室温下离心。
操作步骤
使用前请先在缓冲液GD和漂洗液PW中加入无水乙醇,加入体积请参照瓶上的标签。
取样方式:使用棉签在面颊内擦拭10次。
注意:为了保证样本不被食物或者饮料污染,取样前 30 min内请勿进食和饮水。
1. 处理材料:
将在面颊内擦拭过的棉签转置于2 ml离心管中,用剪刀将棉签部分从其杆上剪下,加入400 μl缓冲液GA。
注意:如果需要去除RNA,可加入4 μl RNase A(100 mg/ml)溶液(客户自备,目录号:RT405-12),振荡15 sec,室温放置5 min。
2. 加入20 μl Proteinase K溶液,涡旋10 sec混匀,56℃放置60 min,其间每15 min涡旋混
匀数次。
3. 加入400 μl缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10 min。此时溶液应变清亮,简短离心以去除管盖内壁的液滴,然后挤压去除拭子,将尽可能多的裂解液转移至新的离心管
中。
注意1:加入缓冲液GB时可能会产生白色沉淀,一般70℃ 放置时会消失,不会影响后续实验。如溶液未变清亮,说明细胞裂解不彻底,可能导致提取DNA量少和提取出的DNA
不纯。
注意2:如果由于拭子上细胞数少导致提取的基因组DNA少于1 µg,可以在添加缓冲液GB的同时添加Carrier RNA(客户自备,目录号:RT416)。
4. 加200 μl无水乙醇,充分颠倒混匀,简短离心以去除管盖内壁的液滴。
注意:加入无水乙醇后可能会出现絮状沉淀,但不影响DNA提取。
5. 将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CR2中(吸附柱CR2放入收集管中),12,000 rpm (~13,400×g)离心30 sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR2放回收集管
中。
6. 向吸附柱CR2中加入500 μl缓冲液GD(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm(~13,400×g)离心30 sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR2放回收集管中。
7. 向吸附柱CR2中加入600 μl 漂洗液PW(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000 rpm(~13,400×g)离心30 sec,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CR2放回收集管。
8. 重复操作步骤7。
9. 12,000 rpm (~13,400×g)离心2 min,倒掉废液。将吸附柱CR2室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注意:这一步的目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除,漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
10. 将吸附柱CR2转入一个干净的离心管中,向吸附膜中间位置悬空滴加20-50 μl 洗脱缓冲液TB,室温放置2-5 min,12,000 rpm (~13,400×g)离心2 min。
注意:洗脱缓冲液体积不应少于20 μl,体积过小影响回收效率。为增加基因组DNA的得率,可将离心得到的溶液再加入吸附柱CR2中,室温放置2 min,12,000 rpm
(~13,400×g)离心2 min。洗脱液的pH对于洗脱效率有很大影响。若用ddH2O做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率;且DNA产物应保存
在-20℃,以防DNA降解。
DNA浓度及纯度检测
得到的基因组DN**段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。回收得到的DN**段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。
DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260值为1相当于大约50 μg/ml双链DNA、40 μg/ml单链DNA。OD260/OD280比值应为1.7-1.9,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用ddH2O,比值会偏低,因为pH值和离子存在会影响光吸收值,但并不表示纯度低。
选配试剂 RNase A(100 mg/ml);Carrier RNA储存条件 该试剂盒置于室温(15-25℃)干燥条件下,可保存12个月,更长时间的保存可置于 2-8℃。2-8℃保存条件下,若溶液产生沉淀,使用前应将试剂盒内的溶液在室温放置一段时 间,必要时可在37℃水浴中预热10 min,以溶解沉淀。
口腔拭子基因组DNA提取试剂盒
作者:上海雅吉生物科技有限公司 2021-04-02T00:00 (访问量:1431)
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