同普通蛋白A琼脂糖凝胶相比，耐碱蛋白A琼脂糖凝胶FF大大提高了凝胶的耐碱性，可以使用0.1~0.5M NaOH溶液去除热源或对凝胶进行清洗。琼脂糖凝胶骨架上的延伸碳臂和重组耐碱蛋白A上的定向结合位点的设计保证了两者之间的定向牢固结合。

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